MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG01

Total Repeats: 7579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013923	ACT	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583312
2	NC_013923	CACC	2	8	277	284	25 %	0 %	0 %	75 %	289583312
3	NC_013923	GT	5	10	317	326	0 %	50 %	50 %	0 %	289583312
4	NC_013923	CTTCG	2	10	353	362	0 %	40 %	20 %	40 %	289583312
5	NC_013923	ACT	2	6	382	387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583312
6	NC_013923	TGA	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583312
7	NC_013923	AC	3	6	447	452	50 %	0 %	0 %	50 %	289583312
8	NC_013923	TGG	2	6	506	511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583312
9	NC_013923	CGA	2	6	577	582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
10	NC_013923	GGA	2	6	595	600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583313
11	NC_013923	CTC	2	6	623	628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583313
12	NC_013923	TCG	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583313
13	NC_013923	ACTGGC	2	12	755	766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289583313
14	NC_013923	TG	3	6	774	779	0 %	50 %	50 %	0 %	289583313
15	NC_013923	TCG	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583313
16	NC_013923	CGA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
17	NC_013923	TAC	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583313
18	NC_013923	CAA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583313
19	NC_013923	ACG	2	6	999	1004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
20	NC_013923	TCA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583313
21	NC_013923	CGA	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
22	NC_013923	CCG	2	6	1199	1204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583313
23	NC_013923	CAT	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583313
24	NC_013923	GAG	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583313
25	NC_013923	TC	3	6	1504	1509	0 %	50 %	0 %	50 %	289583313
26	NC_013923	ACG	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
27	NC_013923	ACG	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583313
28	NC_013923	GTC	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583313
29	NC_013923	TCG	2	6	1636	1641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583313
30	NC_013923	GCG	2	6	1701	1706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583313
31	NC_013923	GGAA	2	8	1714	1721	50 %	0 %	50 %	0 %	289583313
32	NC_013923	TTCG	2	8	2569	2576	0 %	50 %	25 %	25 %	289583314
33	NC_013923	ACG	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583314
34	NC_013923	GCCA	2	8	2659	2666	25 %	0 %	25 %	50 %	289583314
35	NC_013923	TCG	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583314
36	NC_013923	CTG	3	9	2742	2750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583314
37	NC_013923	TGG	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583314
38	NC_013923	TAC	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583315
39	NC_013923	CGA	2	6	2954	2959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583315
40	NC_013923	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583315
41	NC_013923	GTT	2	6	2997	3002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289583315
42	NC_013923	AAC	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583315
43	NC_013923	GA	3	6	3062	3067	50 %	0 %	50 %	0 %	289583315
44	NC_013923	CTG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583315
45	NC_013923	GAA	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583315
46	NC_013923	GCG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583315
47	NC_013923	GAAA	2	8	3232	3239	75 %	0 %	25 %	0 %	289583315
48	NC_013923	TGTA	2	8	3600	3607	25 %	50 %	25 %	0 %	289583316
49	NC_013923	CCT	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583316
50	NC_013923	GAA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583316
51	NC_013923	ACT	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583316
52	NC_013923	CCA	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583316
53	NC_013923	TCG	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583316
54	NC_013923	CGAA	2	8	3792	3799	50 %	0 %	25 %	25 %	289583316
55	NC_013923	CGC	2	6	3816	3821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583316
56	NC_013923	GAG	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583316
57	NC_013923	CACGAC	3	18	4124	4141	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289583317
58	NC_013923	AAC	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583317
59	NC_013923	ACA	2	6	4158	4163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583317
60	NC_013923	ACG	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583317
61	NC_013923	CAA	2	6	4189	4194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583317
62	NC_013923	CTA	2	6	4215	4220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583317
63	NC_013923	ACC	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583317
64	NC_013923	GCG	2	6	4374	4379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583317
65	NC_013923	CGAG	2	8	4417	4424	25 %	0 %	50 %	25 %	289583317
66	NC_013923	GAC	2	6	4462	4467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583317
67	NC_013923	GCGA	2	8	4489	4496	25 %	0 %	50 %	25 %	289583317
68	NC_013923	GCGT	2	8	4606	4613	0 %	25 %	50 %	25 %	289583317
69	NC_013923	GAC	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583318
70	NC_013923	TCG	2	6	5043	5048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583318
71	NC_013923	AACG	2	8	5050	5057	50 %	0 %	25 %	25 %	289583318
72	NC_013923	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583318
73	NC_013923	TGA	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583318
74	NC_013923	CGA	2	6	5311	5316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583318
75	NC_013923	TGT	2	6	5317	5322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289583318
76	NC_013923	CCT	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583318
77	NC_013923	CGAC	2	8	5397	5404	25 %	0 %	25 %	50 %	289583318
78	NC_013923	GCC	3	9	5458	5466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583318
79	NC_013923	TCGA	2	8	5522	5529	25 %	25 %	25 %	25 %	289583318
80	NC_013923	CGG	2	6	5530	5535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583318
81	NC_013923	ATC	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583318
82	NC_013923	ACG	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583318
83	NC_013923	CGT	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583318
84	NC_013923	CGA	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583318
85	NC_013923	GTC	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583318
86	NC_013923	CGG	2	6	5834	5839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583318
87	NC_013923	TCG	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583319
88	NC_013923	GC	3	6	5893	5898	0 %	0 %	50 %	50 %	289583319
89	NC_013923	TCAC	2	8	5902	5909	25 %	25 %	0 %	50 %	289583319
90	NC_013923	CGTC	2	8	5993	6000	0 %	25 %	25 %	50 %	289583319
91	NC_013923	GTTC	2	8	6005	6012	0 %	50 %	25 %	25 %	289583319
92	NC_013923	TGC	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583319
93	NC_013923	CCTG	2	8	6074	6081	0 %	25 %	25 %	50 %	289583319
94	NC_013923	CGT	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583319
95	NC_013923	CGA	3	9	6122	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583319
96	NC_013923	CGA	2	6	6257	6262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583319
97	NC_013923	CGA	2	6	6347	6352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583319
98	NC_013923	ACC	2	6	6614	6619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583320
99	NC_013923	GCT	2	6	6658	6663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583320
100	NC_013923	CTG	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583320
101	NC_013923	CTG	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583320
102	NC_013923	TTCG	2	8	6772	6779	0 %	50 %	25 %	25 %	289583320
103	NC_013923	GTA	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583320
104	NC_013923	TC	3	6	6802	6807	0 %	50 %	0 %	50 %	289583320
105	NC_013923	CGCAG	2	10	6814	6823	20 %	0 %	40 %	40 %	289583320
106	NC_013923	GTCG	2	8	6827	6834	0 %	25 %	50 %	25 %	289583320
107	NC_013923	GTGC	2	8	6848	6855	0 %	25 %	50 %	25 %	289583320
108	NC_013923	CAGC	2	8	7076	7083	25 %	0 %	25 %	50 %	289583321
109	NC_013923	GTGC	2	8	7101	7108	0 %	25 %	50 %	25 %	289583321
110	NC_013923	GCC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583321
111	NC_013923	GCA	2	6	7295	7300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583321
112	NC_013923	TGA	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583321
113	NC_013923	TAC	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583322
114	NC_013923	GTC	2	6	7552	7557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583322
115	NC_013923	GCG	2	6	7588	7593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583322
116	NC_013923	GCC	2	6	7615	7620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583322
117	NC_013923	CGCTCA	2	12	7621	7632	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289583322
118	NC_013923	ATTTC	2	10	7654	7663	20 %	60 %	0 %	20 %	289583322
119	NC_013923	TAG	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583323
120	NC_013923	GT	3	6	7846	7851	0 %	50 %	50 %	0 %	289583323
121	NC_013923	GTT	2	6	7863	7868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289583323
122	NC_013923	TAG	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583323
123	NC_013923	TGA	2	6	7903	7908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583323
124	NC_013923	GAA	2	6	7975	7980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583323
125	NC_013923	GAA	2	6	8000	8005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583323
126	NC_013923	C	6	6	8037	8042	0 %	0 %	0 %	100 %	289583323
127	NC_013923	GCG	2	6	8046	8051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583323
128	NC_013923	TCG	2	6	8192	8197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583323
129	NC_013923	CGA	2	6	8210	8215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583323
130	NC_013923	CATC	2	8	8255	8262	25 %	25 %	0 %	50 %	289583323
131	NC_013923	TGTCAG	2	12	8394	8405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289583324
132	NC_013923	TCAGTA	2	12	8426	8437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289583324
133	NC_013923	TGTC	2	8	8460	8467	0 %	50 %	25 %	25 %	289583324
134	NC_013923	CT	3	6	8493	8498	0 %	50 %	0 %	50 %	289583324
135	NC_013923	TCCC	2	8	8502	8509	0 %	25 %	0 %	75 %	289583324
136	NC_013923	C	6	6	8507	8512	0 %	0 %	0 %	100 %	289583324
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138	NC_013923	TTC	2	6	8609	8614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583324
139	NC_013923	GA	3	6	8615	8620	50 %	0 %	50 %	0 %	289583324
140	NC_013923	TTC	2	6	8654	8659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583324
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146	NC_013923	GTC	2	6	9188	9193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583324
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259	NC_013923	AC	3	6	16253	16258	50 %	0 %	0 %	50 %	289583332
260	NC_013923	CGAC	2	8	16352	16359	25 %	0 %	25 %	50 %	289583332
261	NC_013923	GGA	2	6	16382	16387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583332
262	NC_013923	CTG	2	6	16391	16396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583332
263	NC_013923	CCG	2	6	16445	16450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583332
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265	NC_013923	TCG	2	6	16501	16506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583332
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291	NC_013923	CGA	2	6	18005	18010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583334
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329	NC_013923	AGC	2	6	20320	20325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583336
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332	NC_013923	CGA	3	9	20496	20504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583336
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363	NC_013923	ACT	2	6	22061	22066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583337
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369	NC_013923	TCGC	2	8	22500	22507	0 %	25 %	25 %	50 %	289583338
370	NC_013923	CGT	2	6	22520	22525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583338
371	NC_013923	CGA	2	6	22535	22540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583338
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373	NC_013923	TCG	2	6	22564	22569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583338
374	NC_013923	CGT	2	6	22595	22600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583338
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376	NC_013923	CCT	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583338
377	NC_013923	CGA	2	6	22802	22807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583338
378	NC_013923	CGT	3	9	22823	22831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583338
379	NC_013923	TGC	2	6	22839	22844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583338
380	NC_013923	TCGA	2	8	22846	22853	25 %	25 %	25 %	25 %	289583338
381	NC_013923	TCC	2	6	22879	22884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583338
382	NC_013923	TCG	2	6	22891	22896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583338
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384	NC_013923	TCGTCT	2	12	22961	22972	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289583338
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